Triagem in silico de bioatividade de compostos encontrados na espécie Stryphnodendron pulcherrimum
DOI:
https://doi.org/10.36414/rbmc.v10i24.179Palavras-chave:
Efeito Antibacteriano, Modelagem Farmacofórica, Plantas Medicinais, Produtos naturaisResumo
O presente artigo diz respeito a um estudo experimental computacional (in silico) com o objetivo de elucidar os efeitos biológicos ativos de compostos encontrados na espécie S. pulcherrimum (“barbatimão”) e identificar as moléculas potenciais para ação antimicrobiana. Os componentes químicos do Stryphnodendron pulcherrimum foram levantados em literatura por meio dos sites Pubmed, Scielo e SienceDirect. Em seguida, foram determinadas as propriedades farmacocinéticas e os mecanismos de ação dos compostos identificados pelas plataformas “SwissADME”, “SwissTarget” e “PASS Prediction”. Para maior compreensão das atividades biológicas potenciais para efeito antibacteriano, utilizou-se a base de dados “BindingDB”, a fim de reconhecer e comparar outras moléculas que atuam de forma potente (menor IC50) sobre alvos responsáveis por atividades antibacterianas. Dentre os compostos descritos, 8 foram abordados a partir de uma revisão bibliográfica. Ao se considerar as predições farmacocinética e toxicológica, apenas 2 moléculas (metaloproteina I e II) apresentaram-se promissoras à atividade biológica antibacteriana do Stryphnodendron pulcherrimum. Atualmente, o tratamento da infecção pelo S. aureus vem sendo cada vez mais modificado, em decorrência da resistência adquirida com o uso excessivo dos antibióticos e com o surgimento de novas cepas, justificando a necessidade de busca por novas moléculas, possivelmente modificadoras da doença e com menos efeitos colaterais que os fármacos atualmente utilizados. Os resultados do presente estudo favorecem desenvolvimento de futuros testes in vitro e in vivo que corroborem com as análises in silico obtidas nesta pesquisa.
Downloads
Referências
Ricardo LM, Dias BM, Mügge FLB, Leite VV, Brandão MGL. Evidence of traditionality of Brazilian medicinal plants: The case studies of Stryphnodendron adstringens (Mart.) Coville (barbatimão) barks and Copaifera spp. (copaíba) oleoresin in wound healing. J Ethnopharmacol. 2018;219:319-336.
Souza-Moreira TM, Queiroz-Fernandes GM, Pietro RCLR. Stryphnodendron Species Known as "Barbatimão": A comprehensive report. Molecules. 2018;23(4):910.
Santos INLD, Lopes MTG, Valente MSF, Lima Júnior MDJV, Fraxe TDJP. Avaliação genética em sementes de Stryphnodendron pulcherrimum sob diferentes níveis de temperatura. Sci For. 2020;48.
Baldivia DDS, Leite DF, Castro DTHD, Campos JF, Santos UPD, Paredes-Gamero EJ, Carollo CA, Silva DB, De Picoli Souza K, Dos Santos EL. Evaluation of In Vitro Antioxidant and Anticancer Properties of the Aqueous Extract from the Stem Bark of Stryphnodendron adstringens. IJMS. 2018;19:2432.
Gomes PWP, Pamplona TCDL, Navegantes-Lima KC, Quadros LBG, Oliveira ALB, Santos SM, E Silva CYY, Silva MJC, Souza JNS, Quirós-Guerrero LM, et al. Chemical composition and antibacterial action of Stryphnodendron pulcherrimum bark extract, “barbatimão” species: Evaluation of its use as a topical agent. Arabian Journal of Chemistry. 2021;14:103183.
Daina A, Michielin O, Zoete V. SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules. Sci Rep. 2017;7:42717.
Daina A, Michielin O, Zoete V. SwissTargetPrediction: updated data and new features for efficient prediction of protein targets of small molecules. Nucleic Acids Research. 2019;47:W357–W364.
Filimonov DA, Lagunin AA, Gloriozova TA, Rudik AV, Druzhilovskii DS, Pogodin PV, Poroikov VV. Prediction of the Biological Activity Spectra of Organic Compounds Using the Pass Online Web Resource. Chem Heterocycl Comp. 2014;50:444–457.
Liu T, Lin Y, Wen X, Jorissen RN, Gilson MK. BindingDB: a web-accessible database of experimentally determined protein-ligand binding affinities. Nucleic Acids Res. 2007;35:198-201.
Santos ALD, Santos DO, Freitas CCD, Ferreira BLA, Afonso IF, Rodrigues CR, Castro HC. Staphylococcus aureus: visitando uma cepa de importância hospitalar. J Bras Patol Med Lab. 2007;43:413–423.
Dror O, Shulman-Peleg A, Nussinov R, Wolfson HJ. Predicting molecular interactions in silico: a guide to pharmacophore identification and its applications to drug design. Curr Med Chem. 2004;11(1):71-90.
Hawkins PC, Skillman AG, Nicholls A. Comparison of shape-matching and docking as virtual screening tools. J Med Chem. 2007;50(1):74-82.
Downloads
Publicado
Como Citar
Edição
Seção
Licença
Copyright (c) 2024 REVISTA BRASILEIRA MILITAR DE CIÊNCIAS
Este trabalho está licenciado sob uma licença Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
A submissão de originais para a Revista Brasileira Militar de Ciências implica na transferência, pelos autores, dos direitos de publicação digital. Os autores somente poderão utilizar os mesmos resultados em outras publicações indicando claramente a Revista Brasileira Militar de Ciências como o meio da publicação original. Em virtude de ser uma revista de acesso aberto, permite-se o uso gratuito dos artigos em aplicações educacionais, científicas, não comerciais, desde que citada a fonte (por favor, veja a LicençaCreative Commons no rodapé desta página)